论文和实践环节都没完成，能先提交毕业申请吗？

不能。正文已说明，实践性环节考核和本科论文答辩是毕业申请的前置条件，没成绩系统里提交不了。先确认这两项成绩是否已在系统中显示，再按江苏省教育考试院当次公告的时间提交毕业申请。