我笔试全过了，但论文还没开始，能先申请毕业吗？

不能。毕业申请要求专业计划内课程、实践环节和毕业论文全部完成且成绩合格。论文没答辩、实践没清完，系统里就不满足提交条件，只能等下一轮申报，建议提前问主考院校的论文安排时间。