论文过了但学位没拿到，毕业证还有效吗？

有效。正文表格里写明，毕业申请看的是课程、实践和论文是否合格，通过后获毕业证书，学信网可查；学位是另一套条件，涉及课程平均成绩、学位外语和论文要求，未达标只获毕业证书、无学位。两者不互相否定。