函授站上课拿的毕业证和校本部一样吗？

一样。正文表格里已写明，毕业证书不因上课地点不同而不同，都是国民教育系列，学信网可查。差别只在上课地点、时间安排和管理归属，选哪个主要看你通勤和时间配合度。