在函授站上课，毕业证上和校本部就读的学生有区别吗？

没有性质区别。函授站是院校授权的校外教学点，学籍注册在主办院校，毕业证书由主办院校颁发。核验时看学信网学籍里的院校名称、专业、学习形式三个字段，对得上即可，上课地点不体现在证书上。