我在绍兴报自考，是不是必须选绍兴本地的主考院校？

不是。自考选的是专业，主考院校跟着专业走。绍兴本地常被提到的几所院校只是部分专业的主考单位，你报的专业由哪所院校主考，以浙江省教育考试院当年公布的专业计划为准，和你在哪个城市居住没有绑定关系。