课程都考完了，是不是就能直接申请毕业？

不一定。还要确认实践环节成绩已录入、毕业论文已报考并合格、专升本专科学历在学信网可查、个人信息与身份证一致。这4项缺一项都可能被退回，先逐项核对再提交。