南京成人高考的毕业证在学信网查不到，是不是就不被承认？

不能直接这样判断。查不到要先排除四种情形：证书尚未完成电子注册、报读的并非国民教育系列项目、前置学历信息有误、证书信息与本人身份信息不一致。逐一核对后走江苏省教育考试院或毕业院校的官方渠道确认，再下结论。