理论课还没全部考完，能不能先报论文？

不能。正文里写明，论文申请的前提是所有课程（含实践环节）成绩合格，多数院校直接不予受理。正确顺序是先考完理论课、再做实践、最后申请论文，顺序反了报名环节就会卡住。