课程都考完了，是不是就能直接申请毕业？

不一定。课程通过只说明学分这一关大概率过了，还要确认实践环节是否完成、本科论文是否答辩合格，以及专科前置学历能否在学信网查到。这几项齐了，才谈得上提交毕业申请。