新生注册时就要把论文费、毕业审定费一起交吗？

不用。这几笔费用发生时间不同：报考费在每次报考时交，实践环节考核费和论文指导答辩费在对应课程通过后由主考院校收取，毕业审定费在申请毕业时才产生。新生注册阶段只需要关注当次报考的科目和对应报考费。