函授站读出来的毕业证和校本部有区别吗？

没有区别。两种方式拿的都是国民教育系列学历，学信网可查，证书上不标注就读地点。差别在上课通勤、面授与考试安排、事务对接这些过程环节，选哪种主要看你时间是否自由、住处离校远近。