我笔试还剩两门，现在报论文会不会太早？

不算早。按正文的排法，只剩一两门时就可以和最后一门同考期或提前一考期报论文，因为论文从报名到出成绩通常跨一个考期。关键是先查清你专业是否要求实践环节先完成，再按云南省教育考试院和主考院校当年公布的窗口期安排，别等笔试全过才启动。