我在长沙考自考，笔试全过了但论文还没报，能先交毕业申请吗？

不能。毕业审核看的是整套条件，论文成绩合格是其中一项，缺了会被退回。建议先按主考院校继续教育学院的通知申报论文，拿到合格成绩后再对照学分结构核对，确认无缺项再提交申请。