两所学校都能报应用型专业吗？

不一定，要看当年各校开设的专业和助学安排，以安徽省教育考试院和学校继续教育部门公布为准。报名前先拿到专业考试计划，数清统考和校考门数，再决定报哪所、走哪种形式。